Von 1725 bis 1750 amtierte Jakob Münch aus Rauenthal als Abt des Klosters Ilbenstadt. Während seiner Amtszeit wurde die Onymus-Orgel installiert. Sein Abtswappen ziert die Schaufront der Orgel.
1782 wurde die gotische Kirche wegen Baufälligkeit abgerissen. Sie stand am Platz der heutigen Kirche und war in Chor und Langhaus gegliedert. Anders als die heutige Kirche war sie lang gestreckt und schmaler.
Die Kirche St. Maria, St. Petrus und St. Paulus des ehemaligen Prämonstratenserklosters in Ilbenstadt mit ihrer Doppelturmfassade steht weithin sichtbar auf einem Hügelsporn 20 m über der flachen und ehemals sumpfigen Nidda-Aue.